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Tom, Jennifer, Dean und Holly brechen zu einem gemeinsamen Bootsausflug auf, doch das alte Segelboot ist leck und die vier können sich nur mit Mühe vor dem Ertrinken retten. Holly schickt Flipper um Hilfe, während sich die Gruppe auf eine einsame Insel rettet, die – was sie nicht wissen – als Stützpunkt der Navy genutzt wird. Doch Flipper wird auf seinem Weg zum Strand von einem Marinesoldaten gefangen, der Delfine für die Army trainiert.