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Die Mittelschülerin Madoka Kaname ist überrascht, als sie das Mädchen aus ihrem Traum, Homura Akemi , am nächsten Tag an ihrer Schule einschreibt. Homura, die sie bereits zu kennen scheint, warnt Madoka, so zu bleiben, wie sie ist, oder riskieren, alles zu verlieren. Als Madoka nach der Schule mit ihrer Freundin Sayaka Miki einkaufen geht , hört sie eine seltsame Stimme, die sie zu einem verlassenen Teil des Einkaufszentrums führt. Sie trifft auf eine seltsame katzenartige Kreatur namens Kyubey , die von Homura angegriffen wird, die sich als magisches Mädchen entpuppt. Als Homura verlangt, dass Madoka sich von Kyubey fernhält, kommt Sayaka an und entkommt mit Madoka, nur damit sie in einer magischen Barriere gefangen und von seltsamen Monstern angesprochen werden. Sie werden von einem anderen magischen Mädchen namens . gerettetMami Tomoe , die mit ihren magischen Fähigkeiten die Angreifer abwehrt. Homura taucht erneut auf und wird von Mami konfrontiert, die ihr sagt, dass sie den Angriff auf Kyubey übersehen wird, da sie nicht vor den anderen Mädchen kämpfen möchte. Homura geht danach. Kyubey wird von Mamis Kräften geheilt und erklärt, dass er einen Vertrag mit Madoka und Sayaka eingehen möchte, um sie zu magischen Mädchen zu machen.