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Ash und seine Freunde und auch Team Rocket sind auf der gesunkenen M.S. Anne unter Wasser gefangen. Um zu Überleben müssen sie einen Waffenstillstand schließen. Misty übernimmt die Führung, da sie sich auf der M.S. Anne am Besten auskennt. Ihr Plan ist es, sich zum Maschinenraum vorzuarbeiten, da dort die Außenhaut des Schiffs am dünnsten ist. Doch der Weg ist durch ein Feuer versperrt. Mit Bisasams Hilfe gelingt es ihnen, das Feuer unbeschadet zu überqueren. Glumanda schneidet mit einem Feuerstrahl ein Loch in den Schiffsrumpf, und mit Hilfe ihrer Wasser-Pokémon gelangen Ash und seine Freunde sicher an die Wasseroberfläche. Team Rocket ist verzweifelt, denn es hat keine Wasser-Pokémon. Da holt James Karpador, ein Wasser-Pokémon, das er erst vor kurzem gekauft hat, heraus. Er lässt sich von Jessie und Mauzi gebührend als Retter feiern. Doch Karpador ist ein Flopp, er kann nicht schwimmen. Trotzdem schaffen auch sie es, an die Oberfläche zu gelangen, und werden von Ash und seinen Freunden gefunden. Sie treiben auf dem Meer, da entwickelt sich Karpador plötzlich zu dem Wasserzyklon, der Ash, seine Freunde und Team Rocket mit sich reißt. Keiner weiß, wo sie landen werden.