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Als Kaito und die anderen nach Japan zurückkehren, stellen sie fest, dass der Direktor, Baron Kaido, verschwunden ist. Später wird Kaito vom POG an den Ort gerufen, an dem seine Eltern gestorben sind. Als Kaito und die anderen am Ort ankommen und Baron finden, erhält Kaito ein Video, das enthüllt, dass seine Eltern POG-Geber waren, die sein Potenzial für Phi Brain überwachen. Baron enthüllt weiter, dass sie nicht seine richtigen Eltern waren und sich als POG-Mitglied enthüllt. Baron beschließt, Kaito alles über das Phi-Gehirn-Projekt zu erzählen, und enthüllt, dass seine Eltern gegen die Befehle des POG verstoßen und das Narrenrätsel genommen haben, das sie anstelle von Kaito getötet hat, um ihn zu beschützen. Baron zeigt Kaito ein weiteres Video, das zeigt, dass sie ihn, obwohl sie nicht seine richtigen Eltern sind, wirklich wie ihr eigenes Kind liebten, was Rook ebenfalls schockiert. Entschlossen, von seinen Eltern Abschied zu nehmen,Kaito aktiviert seinen Orpheus-Zustand und löst das Narrenrätsel ein für alle Mal. Nachdem er Kaito erzählt hat, dass Jin von der POG gefangen gehalten wird, geht er und wird von der POG wegen seines Verrats gefangen genommen.