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Drei Monate sind vergangen, und in Smallville ist nichts mehr wie es war. Clark ist nach wie vor verschwunden, seitdem er in die Höhlenwand hineingezogen wurde, Jonathan liegt im Koma, Lionel wartet im Gefängnis auf seinen Prozess, und Chloe ist bei der Explosion umgekommen. Einzig Lex hat Grund zur Freude, da er den Mordanschlag nahezu schadlos überstanden hat. Dann taucht plötzlich Chloes Cousine Lois Lane auf, die davon überzeugt ist, dass Chloe nicht einem Unfall sondern einem gezielten Anschlag zum Opfer fiel. Noch vor ihrem Eintreffen in der Stadt lernt sie Clark kennen, den sie in einem verwirrten Zustand, nackt in einem brennenden Maisfeld findet. Doch wie sich bald herausstellt, handelt es sich gar nicht um Clark, sondern vielmehr um seinen Alten Ego: Kal-El...