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Der Neuntklässler Randy Cunningham entdeckt das Ninjanomicon, welches enthüllt, dass er als Norrisvilles neuester Ninja auserwählt ist. Gestärkt durch die Kraft seines Ninja-Anzugs zieht er in seine erste Schlacht mit McFists Monster Krakenstein - und muss gleichzeitig sein Geheimnis bewahren.
Randy und Howard wollen zu den coolen Jungs und Mädchen gehören, aber Randy sieht sich gezwungen, Mitglied der Schulkapelle zu werden, um Bucky zu besiegen, der in die Gewalt des Hexenmeisters geraten ist.