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Während Kyle Sommer (Matt Long) und Dr. Sarah Jordan (Jordan Hayes) versuchen, von der Insel zu fliehen, werden sie von ihren Verfolgern gejagt. Dr. Sarah Walker (Kyra Zagorsky) und Dr. Alan Farragut (Bill Campbell) suchen derweil weiterhin nach dem “Mutterbaum”, um den tödlichen Plan von ILARIA zu vereiteln.