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Nach einem Streit mit Booth kehrt Brennan nachts ins Jeffersonian zurück, um die Leiche eines Mannes zu untersuchen, der angeblich Selbstmord begangen hat. Bei ihren Untersuchungen findet sie allerdings Hinweise darauf, dass das Opfer ermordet wurde. Doch dann schießt plötzlich jemand auf sie. Als Booth ins Institut kommt, um nach ihr zu sehen und sich zu versöhnen, findet er Brennan schwerverletzt am Boden. Während sie im Krankenhaus um ihr Leben kämpft, suchen Brennans Kollegen nach dem Schützen. Die Beweise deuten erschreckenderweise daraufhin, dass der Täter aus dem Umfeld des Jeffersonian kommt ….